245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4284 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  79.72 
 
 
360 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  79.94 
 
 
361 aa  594  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  76.04 
 
 
358 aa  577  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  75.49 
 
 
358 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  68.61 
 
 
359 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  68.06 
 
 
359 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  61.34 
 
 
362 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  57.91 
 
 
367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  55.97 
 
 
368 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  56.21 
 
 
367 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  55.03 
 
 
373 aa  411  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  55.46 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  52.69 
 
 
368 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 
359 aa  381  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  50.99 
 
 
367 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  51.53 
 
 
387 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 
367 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  49.86 
 
 
388 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  49.58 
 
 
388 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  51.97 
 
 
373 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  49.86 
 
 
388 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  48.75 
 
 
391 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  49 
 
 
386 aa  359  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  49.16 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  47.08 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  47.22 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  46.22 
 
 
364 aa  349  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  47.11 
 
 
380 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  46.69 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  45.58 
 
 
387 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
396 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  45.79 
 
 
358 aa  335  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  46.31 
 
 
350 aa  332  6e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  46.93 
 
 
384 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  45.18 
 
 
393 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  45.35 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  45.86 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  47.09 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  43.49 
 
 
360 aa  317  3e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  43.7 
 
 
354 aa  315  6e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.51 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  45.28 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  46.26 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  42.58 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  43.22 
 
 
353 aa  312  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  42.58 
 
 
354 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  45.38 
 
 
353 aa  310  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 
397 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  42.58 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  44.66 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 
357 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  43.85 
 
 
357 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.29 
 
 
371 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
356 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 
355 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 
364 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 
355 aa  288  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  40.56 
 
 
356 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  43.42 
 
 
360 aa  281  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 
386 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
375 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 
354 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 
355 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 
350 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  41.33 
 
 
369 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  40.73 
 
 
353 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 
381 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  41.14 
 
 
348 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  41.14 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  40.78 
 
 
355 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.89 
 
 
384 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  40.29 
 
 
362 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 
345 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  40.69 
 
 
349 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  40.4 
 
 
348 aa  265  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  41.13 
 
 
435 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 
385 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.72 
 
 
366 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  41.46 
 
 
376 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  38.86 
 
 
380 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 
357 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  37.36 
 
 
395 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 
367 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 
362 aa  258  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 
404 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 
394 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  39.01 
 
 
429 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  40.73 
 
 
792 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  39.77 
 
 
359 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40 
 
 
356 aa  256  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  38.51 
 
 
359 aa  256  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 
362 aa  256  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 
365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>