233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0740 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  83.63 
 
 		 353 aa  598  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  81.9 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  79.59 
 
 		 348 aa  586  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  64.69 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  47.13 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  48.04 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  45.92 
 
 		 360 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  44.81 
 
 		 353 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  43.11 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  44.71 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.02 
 
 		 355 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  42.48 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.77 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  44.64 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  42.51 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  41.98 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  41.34 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 		 354 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  42.22 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  39.7 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  39.7 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  39.4 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  42.14 
 
 		 626 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  39.76 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  41.21 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 		 625 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 		 626 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 		 626 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  38.74 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 515 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  38.51 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.12 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  39.94 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 		 388 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.09 
 
 		 373 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  37.13 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.25 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.5 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  38.32 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  36.09 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  36.76 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.21 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  39.24 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.53 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  37.76 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 		 419 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  36.01 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  36.45 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  36.66 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>