232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1735 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 345 aa  721    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  67.25 
 
 		 369 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  56.55 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  55.88 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  55.82 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  55.22 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  54.76 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  55.49 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  54.44 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  51.64 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  49.41 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  53.41 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  54.12 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  50.15 
 
 		 625 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  47.25 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  49.41 
 
 		 626 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  49.41 
 
 		 626 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  49.12 
 
 		 626 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  47.38 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  50.15 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  49.41 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  46.96 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  49.4 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  44.64 
 
 		 348 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  49.4 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  49.56 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  48.38 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  50.89 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  47.79 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  44.93 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  43.31 
 
 		 359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  47.79 
 
 		 353 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  46.22 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  48.06 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  41 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  45.54 
 
 		 395 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  45.93 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  45.93 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  45.64 
 
 		 348 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 399 aa  305  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 515 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  46.05 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  44.55 
 
 		 377 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 394 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 396 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  48.18 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  42.61 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  42.03 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.51 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 387 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40.41 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.55 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.54 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.13 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  41.75 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.66 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  36.34 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 419 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  42.72 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  39.46 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  38.17 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  37.42 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  37.24 
 
 		 388 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  37.24 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.24 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  35.67 
 
 		 376 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  38.19 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.62 
 
 		 453 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.35 
 
 		 376 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  35.84 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  37.46 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.28 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>