237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1958 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  79.68 
 
 
377 aa  636    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  100 
 
 
379 aa  778    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  65.15 
 
 
393 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.5 
 
 
399 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  46.63 
 
 
381 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 
345 aa  299  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  45.98 
 
 
360 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  44.66 
 
 
626 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  43.66 
 
 
358 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  45.48 
 
 
625 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
626 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
626 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  44.88 
 
 
350 aa  289  7e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  45.97 
 
 
348 aa  289  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.98 
 
 
371 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  45.18 
 
 
354 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  45.54 
 
 
363 aa  286  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 
355 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 
355 aa  282  8.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  42.94 
 
 
386 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  44.1 
 
 
357 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  43.58 
 
 
353 aa  278  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  43.98 
 
 
357 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 
375 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  43.3 
 
 
354 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  41.95 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  45.06 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  45.73 
 
 
357 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 
356 aa  272  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  42.98 
 
 
348 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.27 
 
 
355 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.45 
 
 
355 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 
360 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  39.84 
 
 
374 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
347 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 
374 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  43.96 
 
 
348 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  41.14 
 
 
352 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 
396 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  44.2 
 
 
364 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
394 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  40.3 
 
 
359 aa  256  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  41.3 
 
 
348 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  41.3 
 
 
348 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  41 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  39.27 
 
 
395 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 
358 aa  247  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  41.24 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
385 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 
515 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  35.88 
 
 
356 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 
347 aa  226  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.02 
 
 
360 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 
353 aa  224  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 
360 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  34.79 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
348 aa  222  7e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 
358 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 
372 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 
364 aa  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 
359 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  35.2 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 
367 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 
360 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  34.08 
 
 
353 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 
359 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 
358 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 
372 aa  208  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 
364 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 
368 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  35.93 
 
 
362 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  32.58 
 
 
353 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 
396 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.81 
 
 
872 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 
367 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
373 aa  202  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
365 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  35.26 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  34.53 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  34.44 
 
 
376 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  30.73 
 
 
354 aa  200  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 
380 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  35.81 
 
 
373 aa  199  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  34.06 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  32.96 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  30.9 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  35.38 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  34.15 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  35.69 
 
 
384 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>