207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0850 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  100 
 
 
350 aa  730    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  78.51 
 
 
348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  78.22 
 
 
348 aa  579  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  76.79 
 
 
363 aa  569  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  72.29 
 
 
349 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  74.49 
 
 
359 aa  535  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  73.35 
 
 
348 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  73.35 
 
 
348 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  73.07 
 
 
348 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  72.21 
 
 
348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  54.89 
 
 
360 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  51.58 
 
 
355 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 
360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 
352 aa  355  6.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  49.71 
 
 
356 aa  352  8e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  47.98 
 
 
381 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  48.1 
 
 
386 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  46.96 
 
 
369 aa  342  5e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  47.7 
 
 
356 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  48.84 
 
 
357 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  48.84 
 
 
357 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  46.82 
 
 
371 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  48.55 
 
 
364 aa  338  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  49.42 
 
 
625 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  48.7 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  46.96 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  47.08 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  49.71 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  47.7 
 
 
354 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
626 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
626 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  48.55 
 
 
626 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  49.71 
 
 
353 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 
345 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  49.14 
 
 
402 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  47.41 
 
 
357 aa  325  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  47.08 
 
 
348 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 
355 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  46.78 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  49.39 
 
 
347 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  46.04 
 
 
396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 
399 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  47.09 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 
515 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 
394 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.23 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 
377 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  44.88 
 
 
379 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  43.1 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 
373 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 
374 aa  278  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 
367 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  39.59 
 
 
354 aa  276  5e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.71 
 
 
360 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 
368 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 
347 aa  268  8e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  43.07 
 
 
353 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
372 aa  265  7e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 
348 aa  265  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  40.74 
 
 
367 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 
364 aa  265  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  38 
 
 
376 aa  262  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 
358 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 
359 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 
359 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 
358 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  39.71 
 
 
360 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 
372 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  38.22 
 
 
362 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 
359 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  40.9 
 
 
393 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
358 aa  256  4e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 
361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 
388 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  35.82 
 
 
388 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 
388 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 
368 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 
365 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 
373 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
387 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  37.71 
 
 
391 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 
419 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 
386 aa  238  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  38.14 
 
 
362 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 
358 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  34.77 
 
 
371 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
380 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
364 aa  233  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
367 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.27 
 
 
376 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 
367 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  34.11 
 
 
387 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.71 
 
 
384 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.9 
 
 
359 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
367 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.47 
 
 
373 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>