211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3089 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  766    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  56.99 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  55.89 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  54.62 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  53.24 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  55.68 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  51.26 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  54.37 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  54.67 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  51.4 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  50.42 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  50.57 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  50.58 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  51.97 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  50.42 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  50.84 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  51.42 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  50.84 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  50.84 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  50.28 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  50.99 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  48.74 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  48.57 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  50.28 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  46.98 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 		 391 aa  342  8e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  45.9 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  46 
 
 		 386 aa  325  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  46.09 
 
 		 386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  45.45 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  44.01 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  45.22 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  45.61 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  39.77 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  38.86 
 
 		 353 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  38.7 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.39 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  45.48 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  38.92 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  39.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 360 aa  275  9e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  38.35 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  37.92 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  38.35 
 
 		 354 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  41.08 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  38.68 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  40.87 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 375 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  40.68 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.04 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  39.73 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  39.07 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.09 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  36.81 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  37.68 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  36.47 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.68 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 353 aa  236  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.04 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  36.97 
 
 		 859 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.72 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  37.25 
 
 		 859 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  37.75 
 
 		 856 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>