221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0040 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  751    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  80.78 
 
 		 365 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  69.03 
 
 		 367 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  62.92 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  61.52 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  56.35 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  56.9 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  51.4 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 		 800 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  44.85 
 
 		 792 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  42.69 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.22 
 
 		 841 aa  299  6e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  43.93 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  42.29 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  41.43 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  42.02 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.44 
 
 		 859 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.77 
 
 		 779 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.1 
 
 		 872 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  43.84 
 
 		 820 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  42.51 
 
 		 859 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.51 
 
 		 859 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.51 
 
 		 859 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.2 
 
 		 859 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.91 
 
 		 842 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  41.88 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.57 
 
 		 899 aa  278  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  43.06 
 
 		 857 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  40.45 
 
 		 841 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.28 
 
 		 856 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  42.86 
 
 		 944 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.43 
 
 		 453 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  41.9 
 
 		 859 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  42.47 
 
 		 881 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  41.53 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  42.9 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  44.02 
 
 		 884 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.38 
 
 		 737 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  40.06 
 
 		 871 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.74 
 
 		 863 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 826 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.53 
 
 		 741 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.88 
 
 		 867 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  42.07 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.08 
 
 		 737 aa  262  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  39.48 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.46 
 
 		 875 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.12 
 
 		 836 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.51 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40.23 
 
 		 373 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  37.04 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.19 
 
 		 860 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  39.36 
 
 		 852 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  41.89 
 
 		 757 aa  249  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  38.42 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  39.3 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.15 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  39.34 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  41.43 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  37.92 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  38.54 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.92 
 
 		 382 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0645  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 459 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  41.24 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  37.33 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  37.31 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40.8 
 
 		 838 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  40.24 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1418  FO synthase subunit 2  38.17 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  38.51 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2637  Radical SAM domain protein  36.17 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2018  FO synthase subunit 2  37.19 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.595846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1308  FO synthase subunit 2  38.42 
 
 		 454 aa  229  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>