More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3417 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  100 
 
 		 384 aa  791    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  67.04 
 
 		 356 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  61.83 
 
 		 376 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  57.63 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  51.34 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  50.14 
 
 		 370 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  49.57 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  49.43 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  48.53 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  44.79 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 419 aa  308  8e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.73 
 
 		 453 aa  298  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  43.49 
 
 		 859 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  43.49 
 
 		 859 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  43.49 
 
 		 859 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.35 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 		 800 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.32 
 
 		 859 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.33 
 
 		 856 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.34 
 
 		 867 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  43.65 
 
 		 859 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.42 
 
 		 859 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.24 
 
 		 792 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  42.77 
 
 		 820 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  42.94 
 
 		 841 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  40.82 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.01 
 
 		 863 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  42.29 
 
 		 842 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.93 
 
 		 871 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  39.45 
 
 		 435 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  45.72 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.51 
 
 		 860 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  41.9 
 
 		 944 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  41.26 
 
 		 779 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  40 
 
 		 899 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.58 
 
 		 881 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  42.2 
 
 		 836 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.64 
 
 		 872 aa  262  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  40.43 
 
 		 857 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  41.69 
 
 		 826 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 		 373 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.88 
 
 		 841 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  40.92 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.66 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.35 
 
 		 875 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.06 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  41.12 
 
 		 838 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  44.6 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  37.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 356 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  37.47 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.31 
 
 		 737 aa  252  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  38.12 
 
 		 852 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.27 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  37.99 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  44.57 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  38.48 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.19 
 
 		 741 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.19 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.05 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  40.37 
 
 		 884 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.71 
 
 		 382 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 		 364 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  39.46 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  35.73 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  37.71 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  38.32 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 757 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>