274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0592 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  866    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.88 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  46.54 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  44.01 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.33 
 
 		 800 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  46.01 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  46.09 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  46.37 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  45.81 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  45 
 
 		 792 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  45.92 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  46.4 
 
 		 842 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  46.82 
 
 		 841 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  45.69 
 
 		 856 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  45.73 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  46.09 
 
 		 859 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  42.55 
 
 		 820 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  45.48 
 
 		 859 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  45.48 
 
 		 859 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  45.48 
 
 		 859 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  45.28 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.09 
 
 		 867 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  45.8 
 
 		 859 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 		 859 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  42.9 
 
 		 944 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  48.17 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  47.81 
 
 		 857 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.16 
 
 		 863 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.12 
 
 		 841 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.98 
 
 		 899 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.27 
 
 		 884 aa  311  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.01 
 
 		 872 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  44.17 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  43.95 
 
 		 826 aa  308  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.46 
 
 		 871 aa  306  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.54 
 
 		 852 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.73 
 
 		 875 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  45.06 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 		 362 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.77 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  42.7 
 
 		 779 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 881 aa  292  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.9 
 
 		 860 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.57 
 
 		 836 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  41.57 
 
 		 838 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  37.53 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  41.06 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  39.5 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  41.39 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.39 
 
 		 741 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  39.52 
 
 		 391 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.62 
 
 		 737 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.05 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.74 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.83 
 
 		 737 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.17 
 
 		 382 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  41.9 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  34.82 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.36 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  36.93 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  42.18 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  36.56 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  37.77 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  36.29 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  38.32 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 368 aa  255  8e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  39.74 
 
 		 757 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.6 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  36.93 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  37.99 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  37.1 
 
 		 355 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 350 aa  246  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  38.1 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.57 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.75 
 
 		 349 aa  244  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>