244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1054 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  100 
 
 
358 aa  729    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  94.41 
 
 
358 aa  655    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  78.49 
 
 
358 aa  569  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  61.84 
 
 
359 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  61.56 
 
 
359 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  60.45 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  58.94 
 
 
359 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  52.76 
 
 
362 aa  408  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  44.68 
 
 
859 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  44.68 
 
 
859 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  44.68 
 
 
859 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  44.24 
 
 
856 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.45 
 
 
863 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  44.65 
 
 
859 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  43.84 
 
 
842 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  44.07 
 
 
859 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  43.44 
 
 
857 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 
859 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.95 
 
 
841 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  40.17 
 
 
899 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.89 
 
 
884 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.49 
 
 
872 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  40.46 
 
 
852 aa  288  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  40.96 
 
 
867 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  40.4 
 
 
435 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 
419 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  41.81 
 
 
800 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  40.11 
 
 
944 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  39.28 
 
 
792 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  44.6 
 
 
384 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  44.61 
 
 
376 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.24 
 
 
881 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40.98 
 
 
838 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  40 
 
 
820 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  39.88 
 
 
836 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 
365 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.64 
 
 
841 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  39.76 
 
 
860 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  39.58 
 
 
871 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  39.94 
 
 
429 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.66 
 
 
875 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 
362 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
362 aa  263  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.65 
 
 
453 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  41.72 
 
 
362 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.27 
 
 
366 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
358 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 
418 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  41.48 
 
 
361 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  36.03 
 
 
779 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.62 
 
 
356 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
826 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.83 
 
 
741 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.11 
 
 
737 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.26 
 
 
737 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  38.86 
 
 
757 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.18 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  37.61 
 
 
361 aa  235  7e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 
373 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.67 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
360 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 
361 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 
358 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  37.39 
 
 
355 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 
354 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  39.16 
 
 
381 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  35.14 
 
 
371 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
358 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 
356 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 
381 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  36.98 
 
 
355 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  36.91 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 
355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
360 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 
359 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 
357 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.52 
 
 
373 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  35.73 
 
 
364 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
372 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.5 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  38.82 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.97 
 
 
382 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  36.39 
 
 
353 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  35.9 
 
 
349 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  35.71 
 
 
360 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.1 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  34.46 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.45 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>