212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0550 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  773    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  81.03 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  77.81 
 
 		 371 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  72.88 
 
 		 381 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  70.09 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  59.82 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  60 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  56.55 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  56.73 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  55.59 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  53.39 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  55.43 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  52.16 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  54.25 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  53.96 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  53.96 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  53.08 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  52.01 
 
 		 353 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  53.31 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  50 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  47.51 
 
 		 348 aa  342  9e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  48.01 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  51.18 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  51.04 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  50.45 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  47.85 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  46.22 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  49.12 
 
 		 348 aa  332  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  48.82 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  46.4 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  47.95 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  48.82 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  48.22 
 
 		 394 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  46.18 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  46.18 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  50.28 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  46.22 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  48.21 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  45.86 
 
 		 385 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  50.14 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  45.69 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 515 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  46.33 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  46.27 
 
 		 374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  43.68 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 358 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  43.55 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.45 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.4 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  39.88 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  44.13 
 
 		 393 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  40.96 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  42.17 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.92 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 		 358 aa  252  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  38.52 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  38.55 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  40.45 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  37.88 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  35.83 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.81 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.68 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  36.18 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  40.84 
 
 		 859 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>