238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1620 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  100 
 
 		 358 aa  730    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  94.41 
 
 		 358 aa  657    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  78.21 
 
 		 358 aa  570  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  62.95 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  62.12 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  60.17 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  58.66 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  52.49 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.15 
 
 		 863 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  43.16 
 
 		 859 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  43.16 
 
 		 859 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  43.16 
 
 		 859 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  43.03 
 
 		 856 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  43.43 
 
 		 859 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 		 859 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  44.55 
 
 		 842 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.86 
 
 		 859 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  42.81 
 
 		 857 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.04 
 
 		 841 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  40.11 
 
 		 899 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  42.41 
 
 		 884 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  42.37 
 
 		 800 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.49 
 
 		 872 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.02 
 
 		 867 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  39.55 
 
 		 792 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  39.31 
 
 		 852 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  44.57 
 
 		 384 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  39.54 
 
 		 944 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  43.71 
 
 		 376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  43.15 
 
 		 881 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.43 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40.67 
 
 		 838 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  40.94 
 
 		 841 aa  269  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  39.88 
 
 		 836 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.23 
 
 		 875 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  39.22 
 
 		 860 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  39.72 
 
 		 820 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  37.68 
 
 		 871 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  39.66 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  39.83 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  43.11 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.65 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  36.49 
 
 		 779 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  42.9 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.34 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.54 
 
 		 741 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.83 
 
 		 737 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 826 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.97 
 
 		 737 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  39.35 
 
 		 757 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  37.32 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.14 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.62 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  36.93 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  39.65 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.42 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  37.39 
 
 		 355 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  37.64 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  39.71 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 367 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  33.81 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.52 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  35.73 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.69 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  38.76 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  35.61 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  36.11 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  35.83 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  34.32 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  35.34 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  36.93 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  38.62 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>