236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0442 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  725    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  86.82 
 
 		 353 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  78.8 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  77.08 
 
 		 357 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  75.86 
 
 		 357 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  76.76 
 
 		 357 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  76.33 
 
 		 347 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  65.8 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  62.46 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  57.59 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  55.75 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  57.93 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  59.6 
 
 		 356 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  53.76 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  53.6 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  53.08 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  53.1 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  51.45 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  51.58 
 
 		 626 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  52.03 
 
 		 625 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  50.58 
 
 		 386 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  51 
 
 		 626 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  51 
 
 		 626 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  49.28 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  51 
 
 		 352 aa  355  7.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  50.14 
 
 		 356 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  51.14 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  48.7 
 
 		 348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.41 
 
 		 348 aa  345  6e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  47.49 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  47.94 
 
 		 381 aa  345  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  48.26 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  48.97 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.7 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  48.38 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  48.21 
 
 		 399 aa  325  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  47.14 
 
 		 402 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  45.35 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  48.13 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  47.21 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  48.13 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.41 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  47.84 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  49.71 
 
 		 380 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  45.06 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  47.13 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  44.63 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  44.21 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 364 aa  291  8e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  41.19 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  43.11 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  42.57 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  41.44 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  42.78 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 368 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  42.74 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.79 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.74 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  40.99 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.12 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.12 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.43 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  36.75 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  36.8 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  36.36 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  37.4 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  37.36 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  38.18 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  34.64 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.18 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>