207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1998 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  813    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  71.12 
 
 		 377 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  65.15 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 625 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  45.68 
 
 		 626 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  47.77 
 
 		 356 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  44.01 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  44.63 
 
 		 360 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  44.23 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  42.37 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  43.73 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  43.02 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 		 357 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  44.41 
 
 		 355 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  42.74 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  41.81 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 		 355 aa  272  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  41.74 
 
 		 353 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 		 364 aa  269  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  38.75 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  41.84 
 
 		 348 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  41.23 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  41.08 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  40.16 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  40.23 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  39.94 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  40.06 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  39.94 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  41.8 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.56 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  41.16 
 
 		 380 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  41.85 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  39.51 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  37.25 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 515 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.78 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 		 353 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  33.9 
 
 		 353 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  36.94 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  35.93 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  31.73 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  34.25 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  36.24 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 390 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  30.59 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  30.79 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  32.12 
 
 		 353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  37.4 
 
 		 779 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  36.91 
 
 		 859 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  36.91 
 
 		 859 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  36.91 
 
 		 859 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.29 
 
 		 872 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  29.69 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  36.23 
 
 		 856 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>