203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4085 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  96.14 
 
 		 389 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  79.79 
 
 		 390 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  75.32 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  76.23 
 
 		 392 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  75.19 
 
 		 382 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  74.16 
 
 		 384 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  45.73 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  48.63 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  47.88 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  48.09 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  46.54 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  45.75 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  44.72 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  43.25 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  45.28 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  44.38 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  43.51 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  44.2 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  41.44 
 
 		 373 aa  300  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  42.03 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  41 
 
 		 371 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  42.86 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  40.43 
 
 		 376 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  38.29 
 
 		 353 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  39.68 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  38.96 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  37.74 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  37.22 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  38.96 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  36.16 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  35.89 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  35.69 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  35.68 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  37.22 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  33.89 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 354 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  35.54 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  35.1 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 357 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 364 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  34.9 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 		 625 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  36.01 
 
 		 626 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 626 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 626 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  34.92 
 
 		 348 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  34.37 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  33.8 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  32.68 
 
 		 348 aa  216  7e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  33.71 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  32.4 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  34.9 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  34.66 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  33.96 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 347 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 364 aa  206  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  33.82 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  32.6 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  32.15 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  32.58 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 353 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  32.62 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>