211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1188 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 387 aa  795    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  76.88 
 
 		 372 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  75.75 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  69.6 
 
 		 380 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  54.62 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  49.86 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  46.46 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  48.43 
 
 		 368 aa  358  8e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  48.43 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  48.43 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  49.43 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  47.01 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  50 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 358 aa  346  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  48.73 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  48.63 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  48.29 
 
 		 361 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  48.63 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  46.01 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  48.63 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  45.58 
 
 		 360 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  46.15 
 
 		 376 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 373 aa  323  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  45.79 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  45.14 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  44.02 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  42.23 
 
 		 392 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  40.17 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  42.28 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  43.18 
 
 		 396 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  40.06 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  41.19 
 
 		 354 aa  288  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  39.71 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  39.14 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  36.47 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  39.14 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  39.2 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  37.33 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  39.14 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  36.54 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  39.71 
 
 		 360 aa  256  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  38.81 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  40.11 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  42.29 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  38.72 
 
 		 626 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  35.57 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 625 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 		 372 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.69 
 
 		 376 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  37.35 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  36.34 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  35.71 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  35.03 
 
 		 359 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.11 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 362 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  34.57 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  35.71 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  36.34 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  34.11 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  34.3 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>