213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0625 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  100 
 
 
359 aa  739    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  73.26 
 
 
359 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  68.61 
 
 
360 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  63.33 
 
 
360 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  63.31 
 
 
358 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  62.75 
 
 
358 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  62.29 
 
 
361 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  60.96 
 
 
362 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  56.86 
 
 
373 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  57.02 
 
 
367 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  56.46 
 
 
373 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  53.61 
 
 
359 aa  401  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  53.5 
 
 
367 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  55.06 
 
 
387 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  53.93 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  53.65 
 
 
388 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  54.21 
 
 
368 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  53.37 
 
 
388 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  53.5 
 
 
368 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  53.03 
 
 
386 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  52.1 
 
 
367 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  50.43 
 
 
367 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  50.56 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  50.99 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  46.24 
 
 
391 aa  352  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  48.75 
 
 
371 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  50.56 
 
 
382 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  50.84 
 
 
384 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  47.31 
 
 
358 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  49.43 
 
 
387 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
392 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  46.38 
 
 
364 aa  342  8e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  47.51 
 
 
386 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  48.19 
 
 
380 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  45.73 
 
 
389 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  45.4 
 
 
376 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  45.48 
 
 
390 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  45.73 
 
 
389 aa  332  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
396 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  44.86 
 
 
353 aa  329  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  46.8 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  43.82 
 
 
354 aa  326  5e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  44.29 
 
 
353 aa  324  1e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 
360 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  42.98 
 
 
354 aa  322  6e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  43.26 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  43.3 
 
 
350 aa  319  6e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  42.7 
 
 
354 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 
354 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  43.26 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  44.48 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.17 
 
 
358 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 
397 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  45.28 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 
360 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
355 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  40.8 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  40.74 
 
 
356 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 
386 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
375 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  43.14 
 
 
360 aa  269  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
365 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  41.09 
 
 
348 aa  266  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
354 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  41.24 
 
 
357 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  41.67 
 
 
380 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 
385 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 
404 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  39.78 
 
 
356 aa  259  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  40.69 
 
 
363 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  42.02 
 
 
355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 
354 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  42.34 
 
 
376 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 
350 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  41.04 
 
 
395 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  37.99 
 
 
366 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
364 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  39.78 
 
 
353 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
394 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
362 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.77 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  39.26 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  39 
 
 
381 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  40.06 
 
 
348 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 
364 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 
419 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  43.09 
 
 
347 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 
357 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.36 
 
 
453 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  40.35 
 
 
348 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 
358 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 
365 aa  246  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
515 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 
435 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>