214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0519 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  81.36 
 
 		 386 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  83.95 
 
 		 384 aa  668    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  93.19 
 
 		 392 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  77.89 
 
 		 389 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  75.19 
 
 		 389 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  72.4 
 
 		 390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  50.56 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  49.32 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  49.18 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  48.77 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  49.16 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  48.77 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  46.26 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  48.04 
 
 		 361 aa  325  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  47.09 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  45.25 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  45.56 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  46.24 
 
 		 368 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  47.78 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  45.22 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  45.18 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  44.04 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  46.07 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  45.22 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  42.28 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  40.56 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  41.96 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  42.46 
 
 		 376 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  41.29 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  37.57 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  43.3 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  38.92 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  38.59 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  38.2 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  36.67 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  36.97 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  36.39 
 
 		 354 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  34.9 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.72 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  37.15 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  35.46 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  37.95 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  37.71 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  37.43 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  37.36 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  35.96 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 625 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.68 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 345 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  37.33 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  34.41 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  37.12 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  39.03 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 352 aa  212  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 		 626 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  36.16 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 		 626 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  35.16 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  33.72 
 
 		 348 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>