213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0220 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  712    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  81.74 
 
 		 353 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  78.8 
 
 		 359 aa  567  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  78.2 
 
 		 362 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  60.17 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  43.1 
 
 		 365 aa  315  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  41.4 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  39.59 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.13 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  37.32 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 367 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  38.53 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.37 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  36.49 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  36.05 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.03 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  39.13 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  36.73 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  34.59 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  37.8 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.42 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  35.86 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  36.26 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  34.59 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.01 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  36.6 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 515 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  37.39 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  34.99 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 387 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  35.38 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  34.29 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  35.43 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  37.97 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  34.29 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  35.17 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  34.29 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.55 
 
 		 453 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  33.9 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  35.17 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  34.73 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  33.43 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  32.48 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  35.16 
 
 		 382 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  34.78 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  35.13 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  31.98 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 391 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  35.52 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  33.82 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  33.82 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>