273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6099 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  89.42 
 
 		 395 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1035    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  74.01 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  73.21 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  70.08 
 
 		 385 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  70.5 
 
 		 404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  74.06 
 
 		 380 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  51.29 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  50 
 
 		 348 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  49.28 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  47.01 
 
 		 364 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  50.29 
 
 		 625 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  47.51 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  47.23 
 
 		 349 aa  329  8e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  47.13 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  51.14 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  45.77 
 
 		 348 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  45.3 
 
 		 357 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 		 355 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  45.56 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  46.09 
 
 		 371 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  44.67 
 
 		 359 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  45.04 
 
 		 358 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  47.63 
 
 		 354 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  45.76 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  45.88 
 
 		 348 aa  317  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 350 aa  316  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  45.66 
 
 		 353 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  45.01 
 
 		 402 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.58 
 
 		 355 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 360 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  47.13 
 
 		 626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  43.95 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  46.84 
 
 		 626 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  46.84 
 
 		 626 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 		 355 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  44.35 
 
 		 345 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  41.91 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  45.19 
 
 		 348 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  42.02 
 
 		 374 aa  299  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  45.48 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  45.48 
 
 		 348 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  45.19 
 
 		 348 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  45.11 
 
 		 347 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 368 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 373 aa  269  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.24 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 358 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 353 aa  262  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 377 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 348 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 347 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 		 372 aa  256  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 360 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.49 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 364 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.71 
 
 		 360 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 367 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 364 aa  248  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 368 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  35.63 
 
 		 367 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  36.96 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  39.72 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.25 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  35.98 
 
 		 353 aa  236  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.54 
 
 		 376 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.11 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  33.89 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  35.04 
 
 		 350 aa  229  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 359 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 419 aa  228  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  34.84 
 
 		 353 aa  228  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  37.61 
 
 		 362 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 		 396 aa  220  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  35.04 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 353 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  34.9 
 
 		 373 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 367 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 358 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 373 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>