208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1029 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  747    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  79.94 
 
 
348 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  76.88 
 
 
363 aa  569  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  77.33 
 
 
348 aa  566  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  74.49 
 
 
350 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  69.19 
 
 
349 aa  503  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  71.8 
 
 
348 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  71.1 
 
 
348 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  70.52 
 
 
348 aa  498  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  70.81 
 
 
348 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  50 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  51.45 
 
 
355 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 
352 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
355 aa  349  5e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  49 
 
 
360 aa  344  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  47.24 
 
 
369 aa  339  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  45.48 
 
 
371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  47.11 
 
 
356 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  48.62 
 
 
355 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 
386 aa  331  9e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  46.92 
 
 
625 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 
356 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  49.85 
 
 
347 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.26 
 
 
396 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  47.69 
 
 
355 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  45.24 
 
 
395 aa  324  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  46.51 
 
 
354 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  46.49 
 
 
364 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  47.21 
 
 
354 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  45.64 
 
 
626 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  47.93 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  46.22 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  45.34 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 
626 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 
626 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 
385 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 
515 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  45.75 
 
 
357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  46.94 
 
 
357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 
357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.47 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  45.06 
 
 
348 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  44.83 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 
402 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 
399 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  39.42 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 
374 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  41.83 
 
 
377 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
368 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 
364 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 
373 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 
367 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 
374 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 
347 aa  263  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.25 
 
 
367 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
359 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.54 
 
 
364 aa  258  9e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 
358 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 
365 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 
358 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 
379 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
360 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 
358 aa  252  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  39.08 
 
 
359 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  40.06 
 
 
393 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.36 
 
 
360 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 
368 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 
361 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  36.21 
 
 
376 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  37.39 
 
 
362 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 
387 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  36.08 
 
 
388 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  39.81 
 
 
419 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 
388 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 
388 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 
372 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  35.41 
 
 
370 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
367 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
358 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 
373 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.5 
 
 
359 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 
435 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  34.3 
 
 
387 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
418 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.35 
 
 
376 aa  225  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  37.94 
 
 
356 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  38.54 
 
 
362 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.37 
 
 
872 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  34.2 
 
 
371 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  34.56 
 
 
359 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  35.87 
 
 
429 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>