248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0284 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  744    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  50 
 
 		 376 aa  371  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  51.34 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  48.08 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  48.48 
 
 		 792 aa  328  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  44.16 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  46.55 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  48.16 
 
 		 859 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  45.29 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  46.91 
 
 		 820 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  45.07 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 419 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  45.67 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  47.98 
 
 		 800 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  47.56 
 
 		 842 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.67 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  43.98 
 
 		 867 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  46.6 
 
 		 841 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  48.14 
 
 		 856 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  46.55 
 
 		 871 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  47.98 
 
 		 841 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  46.56 
 
 		 857 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  47.2 
 
 		 859 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  47.2 
 
 		 859 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  47.2 
 
 		 859 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  42.99 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  45.9 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.3 
 
 		 863 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  47.2 
 
 		 859 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  46.41 
 
 		 381 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  46.89 
 
 		 859 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  46.36 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.22 
 
 		 872 aa  288  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.85 
 
 		 875 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.54 
 
 		 860 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  45.26 
 
 		 899 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.67 
 
 		 382 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.68 
 
 		 944 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  45.37 
 
 		 836 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  45.07 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  45.07 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  46.42 
 
 		 838 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  44.58 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.15 
 
 		 741 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.15 
 
 		 737 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  44.58 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.84 
 
 		 737 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 435 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 418 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  49.21 
 
 		 881 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.21 
 
 		 852 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  44.78 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.47 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.06 
 
 		 884 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.34 
 
 		 779 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 826 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  41.4 
 
 		 366 aa  262  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  46.47 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.75 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  43.04 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  44.52 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  42.99 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.94 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  41.31 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  42.53 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.53 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  40.43 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 368 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.39 
 
 		 355 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 357 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  39.62 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  41.56 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  39.81 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 757 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  41.35 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  39.74 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  38.87 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  38.06 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  39.35 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  36.98 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>