260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2167 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  64.93 
 
 
838 aa  1029    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  65.87 
 
 
857 aa  1105    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  63.06 
 
 
871 aa  1080    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  86.93 
 
 
856 aa  1490    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  64.88 
 
 
859 aa  1073    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  50.66 
 
 
811 aa  732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  66.35 
 
 
899 aa  1069    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  92.2 
 
 
859 aa  1626    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.26 
 
 
792 aa  704    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  74.91 
 
 
863 aa  1281    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.74 
 
 
800 aa  728    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  63 
 
 
867 aa  1061    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  65.11 
 
 
836 aa  1081    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  63.82 
 
 
884 aa  1018    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  64.64 
 
 
872 aa  1081    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  63.57 
 
 
875 aa  1085    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  65.95 
 
 
842 aa  1125    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  65.22 
 
 
852 aa  1075    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  68.65 
 
 
841 aa  1125    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  92.2 
 
 
859 aa  1626    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  94.41 
 
 
859 aa  1630    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  64.85 
 
 
881 aa  1058    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.42 
 
 
779 aa  673    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  92.08 
 
 
859 aa  1626    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  46.84 
 
 
826 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  100 
 
 
859 aa  1741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  64.4 
 
 
860 aa  1056    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.06 
 
 
841 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 
757 aa  559  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  66 
 
 
944 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  64.88 
 
 
416 aa  548  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  60.25 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.72 
 
 
741 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.46 
 
 
737 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  55.27 
 
 
435 aa  373  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  51.45 
 
 
429 aa  364  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  46.74 
 
 
392 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  52.75 
 
 
418 aa  354  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  51.49 
 
 
820 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  48.63 
 
 
380 aa  346  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  49.24 
 
 
359 aa  334  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  49.54 
 
 
370 aa  333  9e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  48.62 
 
 
359 aa  332  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  49.44 
 
 
386 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  46.09 
 
 
419 aa  323  6e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  45.1 
 
 
362 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  44.95 
 
 
359 aa  318  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  48.46 
 
 
376 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.15 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 
367 aa  304  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  44.34 
 
 
366 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  47.85 
 
 
356 aa  294  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  47.2 
 
 
358 aa  292  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.8 
 
 
382 aa  290  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.32 
 
 
384 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.52 
 
 
419 aa  284  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  42.57 
 
 
391 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 
365 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  44.65 
 
 
358 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.41 
 
 
737 aa  280  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 
362 aa  280  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.79 
 
 
352 aa  280  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  43.43 
 
 
381 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.05 
 
 
565 aa  278  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.42 
 
 
352 aa  277  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  42.38 
 
 
358 aa  277  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  42.69 
 
 
380 aa  276  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.69 
 
 
329 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  40.18 
 
 
352 aa  275  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 
390 aa  273  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  43.43 
 
 
358 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  39.88 
 
 
351 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 
384 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.5 
 
 
376 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 
384 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 
364 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  42.49 
 
 
398 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.56 
 
 
325 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  42.22 
 
 
386 aa  261  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.39 
 
 
321 aa  260  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  44.51 
 
 
331 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  39.26 
 
 
356 aa  258  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 
362 aa  257  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 
362 aa  254  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  39.89 
 
 
372 aa  249  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 
355 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 
327 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.25 
 
 
355 aa  248  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  41.08 
 
 
358 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  38.44 
 
 
361 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.79 
 
 
358 aa  244  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.46 
 
 
389 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.79 
 
 
393 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 
360 aa  240  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.08 
 
 
361 aa  240  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
355 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  41.07 
 
 
330 aa  239  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 
360 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
361 aa  238  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  41.32 
 
 
368 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>