262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1148 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.8 
 
 		 872 aa  1117    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  62.34 
 
 		 871 aa  1082    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  47.43 
 
 		 826 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.81 
 
 		 779 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  65.63 
 
 		 860 aa  1089    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  63.63 
 
 		 867 aa  1071    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  66.95 
 
 		 838 aa  1054    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  50.12 
 
 		 811 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  65.28 
 
 		 899 aa  1073    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  48.19 
 
 		 820 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  75.85 
 
 		 859 aa  1312    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.52 
 
 		 792 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  66.26 
 
 		 859 aa  1107    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  74.79 
 
 		 856 aa  1282    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  64.59 
 
 		 881 aa  1059    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  67.1 
 
 		 857 aa  1127    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  65.18 
 
 		 884 aa  1053    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  66.47 
 
 		 836 aa  1122    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  68.97 
 
 		 842 aa  1170    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  66.51 
 
 		 852 aa  1122    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  70.23 
 
 		 841 aa  1168    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  75.85 
 
 		 859 aa  1312    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  75.35 
 
 		 859 aa  1283    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.08 
 
 		 800 aa  742    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  75.97 
 
 		 859 aa  1314    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  100 
 
 		 863 aa  1760    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  74.91 
 
 		 859 aa  1275    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.11 
 
 		 875 aa  1103    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.23 
 
 		 841 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 757 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  67.86 
 
 		 944 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  65.45 
 
 		 416 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  62.18 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.07 
 
 		 741 aa  429  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.16 
 
 		 737 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.88 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  54.91 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  52.34 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  51.71 
 
 		 418 aa  360  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  47.69 
 
 		 392 aa  343  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  46.73 
 
 		 359 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  47.02 
 
 		 359 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  46.73 
 
 		 370 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  46.29 
 
 		 362 aa  327  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  48.4 
 
 		 380 aa  327  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  44.64 
 
 		 359 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  47.73 
 
 		 386 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 		 419 aa  314  5.999999999999999e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  47.55 
 
 		 376 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.43 
 
 		 453 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  44.9 
 
 		 367 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 		 358 aa  292  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  42.26 
 
 		 358 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  42.52 
 
 		 352 aa  289  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  42.9 
 
 		 352 aa  288  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  42.77 
 
 		 352 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 		 329 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.36 
 
 		 382 aa  283  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  43.45 
 
 		 358 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  46.63 
 
 		 356 aa  281  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  43.45 
 
 		 565 aa  280  9e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.88 
 
 		 419 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  42.77 
 
 		 380 aa  280  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 		 390 aa  278  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  41.85 
 
 		 366 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  43.15 
 
 		 358 aa  278  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.01 
 
 		 384 aa  276  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  42.07 
 
 		 376 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 365 aa  275  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  41.23 
 
 		 351 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  43.15 
 
 		 381 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 		 331 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.79 
 
 		 391 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  41.19 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  41.19 
 
 		 384 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 		 362 aa  266  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.82 
 
 		 389 aa  264  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.43 
 
 		 325 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  41.59 
 
 		 398 aa  261  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.03 
 
 		 387 aa  261  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  41.49 
 
 		 321 aa  258  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  44.34 
 
 		 368 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.63 
 
 		 393 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  40.65 
 
 		 362 aa  254  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  43.07 
 
 		 386 aa  252  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 364 aa  250  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  41.07 
 
 		 330 aa  249  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  41.25 
 
 		 327 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.01 
 
 		 356 aa  247  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 362 aa  247  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  39.89 
 
 		 372 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  36.92 
 
 		 361 aa  241  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 360 aa  239  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  41.24 
 
 		 372 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.51 
 
 		 355 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  39.62 
 
 		 371 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  36.92 
 
 		 361 aa  231  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 355 aa  231  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  40.06 
 
 		 326 aa  229  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 368 aa  228  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>