156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0044 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  100 
 
 
351 aa  710    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  77.14 
 
 
352 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  76.29 
 
 
352 aa  567  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  75.71 
 
 
352 aa  557  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  65.82 
 
 
380 aa  494  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
800 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  48.4 
 
 
330 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  49.21 
 
 
325 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  48.61 
 
 
331 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  43.25 
 
 
392 aa  289  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  48.42 
 
 
321 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.1 
 
 
881 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  47.92 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  42.42 
 
 
792 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  41.02 
 
 
380 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.02 
 
 
860 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.41 
 
 
836 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  38.5 
 
 
820 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.2 
 
 
838 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  44.41 
 
 
884 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.39 
 
 
565 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.23 
 
 
863 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.93 
 
 
867 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.02 
 
 
859 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  40.37 
 
 
859 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  40.37 
 
 
859 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  40.37 
 
 
859 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  41.82 
 
 
779 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  39.88 
 
 
859 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.71 
 
 
842 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  38.82 
 
 
856 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  42.33 
 
 
857 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.57 
 
 
871 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  40.11 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  39.45 
 
 
859 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.44 
 
 
419 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  46.3 
 
 
327 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.45 
 
 
872 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.24 
 
 
875 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  40.3 
 
 
811 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  39.45 
 
 
852 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  43.3 
 
 
326 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.39 
 
 
416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.26 
 
 
841 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  39.63 
 
 
826 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  38.77 
 
 
430 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  38.84 
 
 
841 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.06 
 
 
899 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  41.12 
 
 
944 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  36.67 
 
 
368 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  38.41 
 
 
387 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.48 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.65 
 
 
389 aa  232  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  36.97 
 
 
372 aa  229  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.91 
 
 
741 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.4 
 
 
737 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.65 
 
 
737 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 
757 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  37.81 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  38.15 
 
 
318 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  36.99 
 
 
319 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  35.58 
 
 
340 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  36.1 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.46 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  35.14 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  35.26 
 
 
307 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  25.16 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.52 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.68 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  21.66 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  31.43 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  25.64 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  32.8 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  24.64 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  23.77 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  24.84 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  24.56 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  29.46 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  24.86 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  23.53 
 
 
356 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  26.47 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  23 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  23.84 
 
 
376 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  22.81 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  22.94 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  23.23 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  27.42 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  22.69 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  23.81 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  22.69 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  22.69 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  22.69 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  20.9 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>