More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0559 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  47.2 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  45.64 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  46.21 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  46.07 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  45.49 
 
 		 361 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  41.89 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  41.78 
 
 		 328 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  41.78 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  42.91 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  45.93 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  42.21 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  45.96 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  44 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.11 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  41.05 
 
 		 329 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  44.7 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  43.64 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  43.64 
 
 		 361 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  42.7 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  44.57 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  42.16 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  42.5 
 
 		 368 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  41.57 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  43.3 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  42.22 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  40.07 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.93 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  44.49 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  41.45 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  41.09 
 
 		 338 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  40.34 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  41.64 
 
 		 332 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  40.81 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  40 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  40.6 
 
 		 344 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  42.03 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  39.66 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  39.66 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  39.31 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  39.31 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  39.31 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  39.31 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  39.31 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  41.72 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  38.68 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  41.04 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  41.09 
 
 		 368 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  41.09 
 
 		 368 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  38.97 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  41.33 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  41.33 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  38.62 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  44.32 
 
 		 327 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  40.75 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  43.22 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.06 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.73 
 
 		 388 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  40.52 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  37.22 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  38.24 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37.88 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  40.73 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  37.13 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  38.29 
 
 		 376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  37.37 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  39.78 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.09 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  37.13 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  37.71 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  39.85 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  35 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.3 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  35.31 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  35.31 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  35.31 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  38.49 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  35.31 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  37.5 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  37.87 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  36.46 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  39.13 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  39.13 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  38.87 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  35 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  38.11 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  39.78 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  37.5 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  34.33 
 
 		 354 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  37.13 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  34.65 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  34.65 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  34.65 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  34.98 
 
 		 350 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  34.65 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  37.59 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  37.59 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  39.1 
 
 		 345 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  42.49 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  36.76 
 
 		 352 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>