More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1584 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  100 
 
 		 329 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  77.02 
 
 		 329 aa  527  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  71.25 
 
 		 329 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  66.67 
 
 		 328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  65.24 
 
 		 328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  67.19 
 
 		 328 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  59.19 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  57.49 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  51.25 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  53.42 
 
 		 368 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  52.53 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  49.53 
 
 		 334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  51.28 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  51.94 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  51.6 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  47.53 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  47.42 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  47 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  43.96 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  49.37 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  46.46 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  46.93 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  47.85 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  45.23 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  42.41 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  46.13 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  41.64 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  41.9 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  43.81 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  43.17 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  43.08 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  40.75 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  40.8 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  40.84 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  40.49 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  41.07 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  37.69 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  40.31 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  40.18 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  39.81 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  41.38 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  42.21 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  41.19 
 
 		 370 aa  238  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  42.19 
 
 		 375 aa  238  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  42.02 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  40.19 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.85 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.19 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  39.75 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  39.25 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.28 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  39.25 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  39.12 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  41.05 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  41.56 
 
 		 411 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  41.93 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  40.68 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  40.37 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  39.06 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  40.31 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  40 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  38.94 
 
 		 412 aa  218  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  40.91 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  39.38 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  39.12 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  36.05 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  41.53 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  40.89 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  40.94 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  40.94 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  40.94 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  39.13 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.94 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  40.45 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  39.23 
 
 		 358 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  38.33 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  37.46 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  39.74 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  39.39 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  37.3 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  37.93 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  37.82 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0160  biotin synthase  39.48 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.32 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  36.01 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  36.43 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  36.43 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  39.31 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  36.36 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  36.91 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  38.05 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  36.2 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  37.58 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>