More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2409 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  100 
 
 
333 aa  689    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  90.27 
 
 
331 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  61.56 
 
 
332 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  59.69 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  60 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  60 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  59.38 
 
 
332 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  63.44 
 
 
332 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  60 
 
 
332 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  57.23 
 
 
376 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  57.68 
 
 
321 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  57.55 
 
 
335 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  57.55 
 
 
335 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  50.76 
 
 
344 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  50.61 
 
 
374 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  49.68 
 
 
412 aa  323  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  48.48 
 
 
353 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  47.87 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  43.44 
 
 
364 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  48.58 
 
 
366 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  48.26 
 
 
363 aa  292  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  43.17 
 
 
333 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  42.72 
 
 
321 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  39.43 
 
 
330 aa  258  7e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.68 
 
 
329 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  42.9 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  41.04 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.59 
 
 
370 aa  248  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  41.19 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.9 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.75 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  40.98 
 
 
334 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  40.31 
 
 
328 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  41.38 
 
 
329 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.83 
 
 
388 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.73 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  42.24 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  41.01 
 
 
333 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  40 
 
 
329 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  38.41 
 
 
328 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  38.41 
 
 
328 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  39.75 
 
 
321 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.42 
 
 
364 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  40.56 
 
 
320 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.27 
 
 
321 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  38.74 
 
 
324 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.88 
 
 
335 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  37.26 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  38.12 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  36.66 
 
 
358 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  40.96 
 
 
361 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  36.96 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.62 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  40.27 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  40.27 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  36.39 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  36.08 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.19 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  36.08 
 
 
331 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  38.44 
 
 
316 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  36.27 
 
 
345 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  39.26 
 
 
368 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  35.76 
 
 
349 aa  208  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.18 
 
 
325 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  35.62 
 
 
334 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  36.89 
 
 
345 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  37.1 
 
 
353 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  35.58 
 
 
338 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.26 
 
 
326 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.23 
 
 
321 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  36.79 
 
 
336 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  35.28 
 
 
368 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  37.3 
 
 
331 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  36.71 
 
 
331 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  36.77 
 
 
342 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  35.24 
 
 
331 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  37.95 
 
 
375 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  36.16 
 
 
346 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  36.16 
 
 
328 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  36.13 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  36.02 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  39.78 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.19 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  38.01 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  40.14 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.19 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  36.77 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  38.01 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  37.97 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  37.74 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  37.33 
 
 
360 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  36.83 
 
 
361 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  36.45 
 
 
340 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  35.31 
 
 
320 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.58 
 
 
352 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>