More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2541 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  100 
 
 
337 aa  685    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  44.72 
 
 
320 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  40.82 
 
 
321 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  35.87 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.41 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  38.84 
 
 
368 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  38.53 
 
 
368 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  38.56 
 
 
361 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  40.53 
 
 
338 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  36.45 
 
 
328 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  43.13 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  36.45 
 
 
328 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  39.51 
 
 
370 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  39.22 
 
 
321 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.94 
 
 
359 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  36.28 
 
 
329 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.66 
 
 
333 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.1 
 
 
364 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  37.89 
 
 
327 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  41.7 
 
 
325 aa  225  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.73 
 
 
329 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  35.84 
 
 
368 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.54 
 
 
330 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  40.43 
 
 
319 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  36.11 
 
 
361 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.62 
 
 
321 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  36.14 
 
 
328 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  35.76 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  37.32 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.37 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  35.47 
 
 
388 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  35.07 
 
 
361 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  41.04 
 
 
299 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.47 
 
 
324 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  35.05 
 
 
326 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.35 
 
 
333 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  38.79 
 
 
324 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  36.52 
 
 
316 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  36.09 
 
 
340 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.94 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  33.33 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  42.09 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  35.4 
 
 
335 aa  198  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  32.48 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  36.94 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.69 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  34.69 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  33.33 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  31.89 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  33.33 
 
 
332 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  35.94 
 
 
332 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  33.69 
 
 
411 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  39.86 
 
 
327 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  33.8 
 
 
341 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  33.64 
 
 
326 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  30.63 
 
 
331 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  32.99 
 
 
331 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  34.15 
 
 
331 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  33.03 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  32.87 
 
 
331 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  34.11 
 
 
376 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  33.45 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  36.2 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  35.04 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  32.17 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  28.97 
 
 
339 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  31.11 
 
 
332 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  32.43 
 
 
370 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  33.57 
 
 
331 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  33.57 
 
 
331 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  33.57 
 
 
331 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  35.53 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  35.26 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  33.53 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  30.03 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  35.34 
 
 
321 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  35.34 
 
 
321 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  34.77 
 
 
337 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  33.1 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  32.22 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  33 
 
 
333 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  31.36 
 
 
334 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  32.06 
 
 
337 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.3 
 
 
321 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  40.21 
 
 
327 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  35.56 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  32.87 
 
 
338 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  32.21 
 
 
351 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  33.57 
 
 
361 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  31.86 
 
 
331 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.92 
 
 
330 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  32.78 
 
 
375 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  32.52 
 
 
352 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  31.96 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  33.09 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>