More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0484 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  100 
 
 
327 aa  647    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  86.54 
 
 
327 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  86.85 
 
 
327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  67.58 
 
 
338 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  57.83 
 
 
325 aa  359  4e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  41.58 
 
 
328 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  41.25 
 
 
328 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  41.23 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.59 
 
 
329 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  37.93 
 
 
329 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  38.66 
 
 
329 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  36.94 
 
 
361 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  38.89 
 
 
331 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.07 
 
 
327 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  35.38 
 
 
328 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  40.07 
 
 
321 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.74 
 
 
328 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  42.01 
 
 
322 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.38 
 
 
333 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  39.65 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  32.35 
 
 
364 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.78 
 
 
388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  35.97 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.49 
 
 
370 aa  218  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  34.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  42.2 
 
 
368 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  42.2 
 
 
368 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.03 
 
 
320 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.93 
 
 
359 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  42.18 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  37.94 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  34.12 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  40.21 
 
 
337 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  33.73 
 
 
332 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  36.58 
 
 
368 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  33.43 
 
 
332 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.01 
 
 
321 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.62 
 
 
321 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.78 
 
 
320 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.53 
 
 
324 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  36.43 
 
 
364 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  35.76 
 
 
333 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.41 
 
 
334 aa  205  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  33.96 
 
 
370 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  32.1 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  34.24 
 
 
376 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  39.34 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  33.75 
 
 
375 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  33.64 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  32.09 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  34.01 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  36.31 
 
 
335 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  36.31 
 
 
335 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  34.01 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  33.67 
 
 
361 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.54 
 
 
330 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  35.37 
 
 
340 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  33.33 
 
 
316 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  33.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  32.31 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  33.66 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  29.75 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  31.42 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  35.19 
 
 
353 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  30.48 
 
 
331 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  29.9 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  32.59 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  33.22 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  30.82 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  34.07 
 
 
337 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  32.36 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  29.18 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  30.54 
 
 
341 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  29.82 
 
 
331 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  29.94 
 
 
412 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  32.52 
 
 
337 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  31.29 
 
 
331 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  29.79 
 
 
331 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  34.04 
 
 
337 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  35.19 
 
 
363 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  30.25 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  31.86 
 
 
366 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  29.59 
 
 
358 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  28.81 
 
 
345 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  31.48 
 
 
374 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  30.45 
 
 
332 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  31.75 
 
 
321 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  31.75 
 
 
321 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  29.82 
 
 
331 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  29.82 
 
 
331 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  29.82 
 
 
331 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>