More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4597 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  100 
 
 		 366 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  66.57 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  66.76 
 
 		 353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  68.91 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  61.08 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  54.97 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  53.7 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  51.92 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  52.52 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  50.32 
 
 		 332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  49.68 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  49.68 
 
 		 332 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  50 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  53.14 
 
 		 332 aa  331  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  49.68 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  45.28 
 
 		 321 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  46.27 
 
 		 331 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  48.58 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  45.28 
 
 		 335 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  45.28 
 
 		 335 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.26 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  46.11 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  43.12 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  41.94 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  42.77 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.91 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  40.12 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  40.24 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.07 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  36.18 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.07 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40.12 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.01 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.96 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  38.99 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  40.48 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  36.2 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  34.86 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  40.34 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  36.48 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.38 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  34.06 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  35.44 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  35.65 
 
 		 320 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  36.51 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  37.87 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  38.64 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  37.34 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.22 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  38.83 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  37.3 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  40.14 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  38.27 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  34.74 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  33.75 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  37.3 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  37.08 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  37.08 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  37.11 
 
 		 352 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  35.42 
 
 		 324 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  37.08 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  40.99 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  38.19 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  39.55 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  40 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  38.19 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  36.77 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  38.51 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  40.99 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  40 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  37.5 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  37.86 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  39.18 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  37.7 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  40.19 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  37.71 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.7 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  40.28 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  37.38 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  37.5 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  37.78 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  34.71 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  38.03 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  36.33 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  36.18 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  30.84 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  35.9 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  36.84 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  31.78 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  38.98 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  37.46 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  36.45 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  37.08 
 
 		 335 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  38.91 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  34.45 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>