More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0612 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  100 
 
 		 333 aa  687    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  57.79 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  56.69 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  57.96 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  57.64 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  56.69 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  57.61 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  57.32 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  56.37 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  56.78 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  57.79 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  56.47 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  56.05 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  57.7 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  56.69 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  56.69 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  57.05 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  57.1 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  55.7 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  56.09 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  56.09 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  55.45 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  55.41 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  54.78 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  54.34 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  58.55 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  53.82 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  58.55 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  56.31 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  53.7 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  56.55 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  54.78 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  54.46 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  53.48 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  54.28 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  54.78 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  56.58 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  53.87 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  54.95 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  54.34 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  56.25 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  53.48 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  54.34 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  55.26 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  55.99 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  56.86 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  54.4 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  54.4 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  54.95 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  55.78 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  53.23 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  54.72 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  53.55 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  54.4 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  52.9 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  54.14 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  54.4 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  52.9 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  55.87 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  52.16 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  53.23 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1658  biotin synthase  56.73 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.688446  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  55.26 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  55.59 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  54.4 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  52.9 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  55.59 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  53.99 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  52.9 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  55.92 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  53.62 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  54.81 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  54.4 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  54.81 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  56.54 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  56.54 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  53.85 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  53.85 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  54.61 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  56.03 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  54.81 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  54.81 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  55.59 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  54.46 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  54.63 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  53.85 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  53.7 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  54.63 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  54.63 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1475  biotin synthase  56.41 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  54.63 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  54.63 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  56.39 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>