More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1928 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  100 
 
 		 376 aa  782    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  57.23 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  55.62 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  56.21 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  55.11 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  54.8 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  54.49 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  54.8 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  54.49 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  54.49 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  54.49 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  54.8 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  54.49 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  54.97 
 
 		 332 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  56.6 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  49.53 
 
 		 321 aa  339  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  48.74 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  47.53 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  47.53 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  47.83 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  45.78 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  52.52 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  46.69 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  52.85 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  49.68 
 
 		 353 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  44.13 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  42.86 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  41.51 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  40.38 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  40.85 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  38.82 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  39.02 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  40.55 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.41 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.41 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.78 
 
 		 329 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40.25 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  39.68 
 
 		 349 aa  236  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.18 
 
 		 388 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  37.85 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  34.67 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  38.24 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  34.67 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  40.33 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  39.41 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.85 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  38.71 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  38.39 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  39.68 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  37.18 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  37.66 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.78 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  37.03 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.86 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  37.58 
 
 		 333 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  39.55 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  42.07 
 
 		 336 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  39.53 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  37.62 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  40.14 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  39.8 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  38.91 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  41.55 
 
 		 350 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  38.05 
 
 		 345 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  42.41 
 
 		 351 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  41.33 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  37.85 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  37.75 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  36.86 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  36.81 
 
 		 341 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  42.41 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  36.77 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  40.19 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  41.24 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  42.07 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  42.07 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  42.07 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  42.07 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  42.07 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  38.02 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  37.97 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  42.07 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  39.68 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  41.58 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  41.58 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  41.02 
 
 		 364 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  37.21 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  40.14 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  40.14 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  38.31 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  40.14 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  41.72 
 
 		 339 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.83 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  40 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  40.54 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  40.54 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  39.68 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  40.89 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  38.39 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  36.57 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>