More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4187 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  100 
 
 		 363 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  66.76 
 
 		 354 aa  484  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  68.91 
 
 		 366 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  67.32 
 
 		 353 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  57.65 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  56.95 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  48.94 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  51.99 
 
 		 344 aa  345  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  52.85 
 
 		 376 aa  345  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  49.24 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  49.24 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  49.55 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  51.06 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  45.79 
 
 		 321 aa  329  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  44.97 
 
 		 335 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  44.97 
 
 		 335 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  48.26 
 
 		 333 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  45.74 
 
 		 331 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  44.72 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.51 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  41.49 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  40.5 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  37.79 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  40.97 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.27 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.27 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.27 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  39.35 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  37.07 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.31 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.05 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.19 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  41.82 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  41.82 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  38.31 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.22 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  35.81 
 
 		 320 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  36.7 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.07 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  41.09 
 
 		 333 aa  203  5e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  37.3 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.94 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.48 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  37.14 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  36.45 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  40.14 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  33.86 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  37.69 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  36.19 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.92 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  39.56 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  36.76 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  39.46 
 
 		 360 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  38.44 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  35.98 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  39.06 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  35.2 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  37.83 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  36.21 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  36.21 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  35.6 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  38.26 
 
 		 337 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  38.18 
 
 		 333 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.38 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  32.48 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  35.81 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  36.73 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  37.87 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  37.82 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  35.21 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  38.31 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  35.21 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  32.42 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.41 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  33.13 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  37.54 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  35.69 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  38.1 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  35.21 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  35.31 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  35.31 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  35.31 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  35.5 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  36.72 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  36.16 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  35.71 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  38.08 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  36.13 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  35.53 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  38.66 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  35.31 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  36.62 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  34.05 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>