More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2972 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  100 
 
 		 345 aa  700    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  90.27 
 
 		 335 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  87.23 
 
 		 331 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  82.23 
 
 		 349 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  88.15 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  87.23 
 
 		 331 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  79.04 
 
 		 341 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  87.23 
 
 		 331 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  87.23 
 
 		 331 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  76.29 
 
 		 332 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  76.29 
 
 		 331 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  74.77 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  75.99 
 
 		 331 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  74.71 
 
 		 347 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  76.29 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  72.83 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  72.34 
 
 		 339 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  74.41 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  67.96 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  70.43 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  68.58 
 
 		 356 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  71.9 
 
 		 335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  40.74 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.81 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.81 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  43.14 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  41.32 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  36.66 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  40.84 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  40.06 
 
 		 329 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  38.06 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  40.99 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  40.31 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  37.37 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.36 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  36.01 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  36.25 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  36.01 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  36.88 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  41.29 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  44.64 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  35.92 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  44.29 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  44.29 
 
 		 361 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.66 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  39.07 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  35.69 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.48 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  38.59 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  35.22 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.74 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  39.86 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  37.5 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  32.91 
 
 		 321 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  37.18 
 
 		 328 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.66 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.06 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  39.12 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  34.08 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  33.86 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  33.86 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  37.22 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.52 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  36.79 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  37.54 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.94 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  36.75 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  36.57 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  36.57 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  35.62 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  35.62 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  35.62 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  38.31 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  34.08 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  37.46 
 
 		 412 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  38.79 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  37.54 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  40.14 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  36.86 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  38.64 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.94 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  39.46 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  36.18 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  36.18 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  34.74 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  38.85 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  36.11 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  33.79 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  35.69 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  36.18 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  36.21 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  38.19 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  37.25 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  35.53 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  34.56 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>