More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3763 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  100 
 
 		 358 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  81.59 
 
 		 361 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  78.42 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  76.29 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  77.27 
 
 		 332 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  77.81 
 
 		 331 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  73.7 
 
 		 349 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  74.24 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  75.68 
 
 		 341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  76.9 
 
 		 339 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  76.29 
 
 		 345 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  75.15 
 
 		 331 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  73.55 
 
 		 347 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  75.08 
 
 		 331 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  73.56 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  69.41 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  74.24 
 
 		 331 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  74.24 
 
 		 331 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  74.24 
 
 		 331 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  71.95 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  68.39 
 
 		 334 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  71.12 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  39.83 
 
 		 370 aa  245  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  41.29 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  45.14 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  41.12 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  41.12 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  40.8 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  36.13 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  38.71 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  36.73 
 
 		 320 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  40.51 
 
 		 364 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.71 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.92 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.66 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  35.88 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  36.21 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  35.87 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  35.88 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  39.12 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  35.55 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  41.16 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  40.59 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  41.16 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  42.21 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  41.16 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.14 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  39.57 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  39.94 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.58 
 
 		 333 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  37.67 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.23 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  36.02 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  38.82 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  36.14 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  40.74 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  37.54 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  40.13 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  38.78 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  35.83 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  37.04 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.01 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  37.04 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  39.2 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  37.25 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  32.49 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  37.25 
 
 		 362 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  38.31 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  38.66 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  35.31 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  33.33 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  36.86 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  36.86 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  36.54 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  33.33 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  36.86 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  36.93 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.72 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  36.72 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  36.3 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  35.55 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  39.58 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  36.86 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  36.72 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  36.72 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  36.86 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  36.72 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  36.72 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  36.72 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  36.65 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  36.72 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  34.82 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  36.72 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>