More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0430 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  100 
 
 		 321 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  49.68 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  44.06 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.99 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  41.19 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  41.19 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  44.84 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  41.59 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  43.73 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  40.82 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  41.64 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  46.21 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  41.04 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  41.85 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  42.54 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  40.19 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.62 
 
 		 329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  39.44 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  41.78 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  40.97 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  39.93 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.49 
 
 		 368 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  42.53 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.18 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  40.28 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  40.12 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  37.14 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.11 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  39.1 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  39.45 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.26 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  37.94 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.26 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  38.58 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  38.1 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.12 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  41.64 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.73 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  38.01 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  36.77 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  33.86 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  36.36 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.16 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  35.58 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  33.75 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  34.38 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  39.43 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.82 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  33.75 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  33.12 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  33.12 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  32.48 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  33.12 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  32.81 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  41.43 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  32.59 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  33.23 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  32.49 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  34.12 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  40.78 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  34.75 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  34.75 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  33.85 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  32.28 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  34.6 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  35.21 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  32.49 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.69 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  31.56 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  32.58 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  34.6 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  35.15 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  40.07 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  35.15 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  35.15 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  36.11 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  35.15 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  34.12 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  35.56 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  35.56 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  35.56 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  32.26 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  35.49 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  36.01 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  32.8 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  32.88 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>