More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1908 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  100 
 
 
370 aa  746    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  79.51 
 
 
375 aa  570  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.75 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  41.56 
 
 
328 aa  242  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  38.25 
 
 
328 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  37.95 
 
 
328 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  41.19 
 
 
329 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.94 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  39.01 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  38.92 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  41.74 
 
 
361 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  38.78 
 
 
330 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  41.03 
 
 
388 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  36.73 
 
 
333 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  38.1 
 
 
321 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  43.2 
 
 
368 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  37.77 
 
 
329 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  44.03 
 
 
361 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  44.03 
 
 
361 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.14 
 
 
368 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.14 
 
 
368 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  40.31 
 
 
327 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  37.54 
 
 
326 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  40.67 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  40.24 
 
 
370 aa  222  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  33.33 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  38.7 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  34.57 
 
 
329 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.51 
 
 
364 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  41.83 
 
 
340 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.35 
 
 
328 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  41.02 
 
 
344 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  41.61 
 
 
337 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  40.81 
 
 
299 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  39.18 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  34.92 
 
 
333 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  33.64 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.04 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  36.62 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  33.93 
 
 
338 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  39.09 
 
 
337 aa  212  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  41.11 
 
 
339 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  40.48 
 
 
336 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  35.91 
 
 
376 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  36.48 
 
 
332 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  38.64 
 
 
342 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  40.34 
 
 
411 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  37.71 
 
 
353 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  37.58 
 
 
352 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  37.58 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  37.17 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  35.49 
 
 
324 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  36.93 
 
 
352 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.3 
 
 
330 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  39.54 
 
 
326 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  35.45 
 
 
350 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  38.1 
 
 
332 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  38.87 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  34.35 
 
 
334 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  37.41 
 
 
332 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.05 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  36.79 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  36.79 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  37.76 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  36.07 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.22 
 
 
320 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  37.5 
 
 
367 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  38.56 
 
 
331 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  39.06 
 
 
336 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  36.27 
 
 
352 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  36.27 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  37.38 
 
 
333 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  36.93 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37.13 
 
 
316 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  38.83 
 
 
356 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  34.08 
 
 
342 aa  193  4e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  34.38 
 
 
327 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.32 
 
 
335 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  34.82 
 
 
345 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  34.82 
 
 
345 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  37.54 
 
 
329 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  36.27 
 
 
351 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  38.61 
 
 
311 aa  192  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  36.49 
 
 
352 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  34.5 
 
 
345 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  34.38 
 
 
369 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  35.2 
 
 
374 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  37.63 
 
 
315 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  33.33 
 
 
338 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  39.29 
 
 
333 aa  191  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  35.59 
 
 
350 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  35.59 
 
 
350 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  35.24 
 
 
324 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>