More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2187 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  100 
 
 		 367 aa  766    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1861  putative biotin synthase  76.88 
 
 		 378 aa  588  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2150  biotin synthase  80.86 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  58.2 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  61.64 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  57.59 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  58.33 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  58.03 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  57.59 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  60 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  60 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  58.02 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  57.28 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  56.79 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  56.97 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  57.05 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  57.05 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  57.05 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  55.84 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  55.19 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  55.19 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  54.87 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  55.19 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  55.19 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  56.31 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  55.52 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  56.39 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  55.94 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  56.57 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  55.59 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  56.82 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  55.19 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  55.16 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  55.77 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  55.52 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  52.48 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  54.84 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.71 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  55.08 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  57.95 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  57.62 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  57.56 
 
 		 350 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  57.62 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  55.84 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  57.62 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  54.43 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  57.56 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  57.28 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  55.21 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  54.52 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  58.63 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  57.62 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  56.57 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  57.62 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  55.69 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  57.23 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  57.23 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  58.63 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  58.63 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  57.62 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  57.23 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  57.62 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  54.19 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  56.17 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  56.59 
 
 		 354 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  57.33 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  55.8 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  58.31 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  55.7 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  57.59 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  57.59 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  55.41 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  56.72 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  54.35 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  54.81 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  55.12 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  55.95 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  56.03 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  55.08 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  54.75 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  55.08 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  54.29 
 
 		 326 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  54.75 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  56.27 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  56.27 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  56.27 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  56.27 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  53.72 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  51.34 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  56.25 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  56.03 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  51.57 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  54.78 
 
 		 354 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  54.75 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>