More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2070 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  100 
 
 
340 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  71.22 
 
 
337 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  69.09 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  68.69 
 
 
336 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  66.26 
 
 
330 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  61.21 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  59.09 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  41.72 
 
 
328 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  41.39 
 
 
328 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  39.67 
 
 
328 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  40.32 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.44 
 
 
328 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  38.51 
 
 
322 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  41.93 
 
 
329 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.3 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.74 
 
 
329 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  41.83 
 
 
370 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.94 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  38.17 
 
 
333 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  38.71 
 
 
319 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  39.69 
 
 
375 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  40.75 
 
 
299 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  40.86 
 
 
327 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  35.89 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.1 
 
 
364 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.09 
 
 
337 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  35.91 
 
 
368 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  35.91 
 
 
368 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.82 
 
 
324 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.01 
 
 
325 aa  199  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  38.19 
 
 
326 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  36 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.99 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  35.09 
 
 
333 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.01 
 
 
388 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  35.1 
 
 
321 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.75 
 
 
324 aa  189  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  36.25 
 
 
359 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.77 
 
 
321 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  33.55 
 
 
333 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  34.98 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.65 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.17 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  31.15 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37.21 
 
 
316 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.1 
 
 
332 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  36.72 
 
 
368 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  33.56 
 
 
321 aa  176  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  34.34 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  34.11 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  34.34 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  34.75 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  33.88 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  33.87 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.38 
 
 
339 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  33.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  32.36 
 
 
376 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  35.69 
 
 
321 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  35.69 
 
 
321 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  33.33 
 
 
332 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  32.81 
 
 
364 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  34.8 
 
 
326 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  33.01 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  32.59 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  34.19 
 
 
331 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  33.77 
 
 
345 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  33.44 
 
 
345 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  34.9 
 
 
361 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  33.94 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  33.77 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  32.28 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  33.98 
 
 
333 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  32.5 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  32.87 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  33.33 
 
 
322 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  33.33 
 
 
336 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  36.36 
 
 
335 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  35.31 
 
 
331 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  31.68 
 
 
349 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  32.52 
 
 
339 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  34.01 
 
 
361 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  32.48 
 
 
364 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  35 
 
 
331 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  33.76 
 
 
332 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  31.97 
 
 
347 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  34.3 
 
 
335 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  33.67 
 
 
361 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  33.33 
 
 
331 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  31.23 
 
 
324 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  33.23 
 
 
331 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>