More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0353 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  100 
 
 		 327 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  91.74 
 
 		 327 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  86.54 
 
 		 327 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  68.5 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  60.51 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  40.59 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  40.26 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.34 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  36 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  41.88 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  40.64 
 
 		 329 aa  231  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.86 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.06 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.25 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  36.75 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  38.89 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  40.99 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.39 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  33.53 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.75 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  38.31 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  39.8 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.6 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  37.84 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  35.84 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  38.24 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  35.54 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.12 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  35.54 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  41.84 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  37.62 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  42.59 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  39.35 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  43.22 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  40.32 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  38.49 
 
 		 364 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  34.06 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  39.44 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.79 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.86 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.13 
 
 		 370 aa  212  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  35.33 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  35.1 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  35.69 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  33.56 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  39.14 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  35.35 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  35.35 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  35.76 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  36.49 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.32 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  34.12 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.53 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  38.93 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  38.93 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  33.86 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  34.2 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.64 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  35.35 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  34.73 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  34.3 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  34.69 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  29.75 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  31.83 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  34.24 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  34.73 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.11 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  36.3 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  31.16 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  30.82 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  32.89 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  33.9 
 
 		 366 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  30.74 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  30 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.69 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  30.58 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  30.53 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  30 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  29.97 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  31.49 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  29.69 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  29.94 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  34.18 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  32.81 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  30.13 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  32.34 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  32.96 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  28.67 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  30.65 
 
 		 361 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  31.96 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  31.96 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  29.8 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  25.6 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>