More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2296 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  100 
 
 
375 aa  754    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  79.51 
 
 
370 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  43.37 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  39.94 
 
 
328 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  39.64 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  42.19 
 
 
329 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  40.49 
 
 
333 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  41.16 
 
 
328 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.2 
 
 
329 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  37.54 
 
 
324 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  38.75 
 
 
319 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  41.8 
 
 
368 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  42.34 
 
 
388 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  41.59 
 
 
327 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  38.23 
 
 
333 aa  235  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  41.49 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  36.25 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.5 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  44.33 
 
 
361 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.79 
 
 
370 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  36.61 
 
 
321 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.24 
 
 
368 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.76 
 
 
368 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  43.3 
 
 
361 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  42.96 
 
 
361 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.47 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.78 
 
 
326 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  41.72 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  38.51 
 
 
361 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40.24 
 
 
359 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.26 
 
 
325 aa  219  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  34.6 
 
 
338 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  39.45 
 
 
344 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  39.32 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  39.69 
 
 
340 aa  215  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  39.27 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  37.95 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  35.93 
 
 
330 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  37.94 
 
 
364 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  39.25 
 
 
337 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  38.67 
 
 
339 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  32.52 
 
 
321 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.98 
 
 
331 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  35.38 
 
 
376 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  37.92 
 
 
324 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  37.84 
 
 
337 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  34.06 
 
 
322 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.31 
 
 
320 aa  202  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  36.48 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.09 
 
 
332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  34.58 
 
 
332 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  37.1 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  34.78 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  34.78 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  34.78 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  34.78 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  34.78 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  36.28 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  40.19 
 
 
336 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  35.26 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  34.47 
 
 
332 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  35.65 
 
 
352 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  34.47 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  35.65 
 
 
352 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.47 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  34.65 
 
 
321 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  34.65 
 
 
321 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  34.47 
 
 
332 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  35.65 
 
 
352 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  34.47 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  35.65 
 
 
352 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  37.86 
 
 
331 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  35.33 
 
 
352 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  34.38 
 
 
327 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  34.07 
 
 
342 aa  191  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  37.74 
 
 
339 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  35.33 
 
 
351 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.24 
 
 
330 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  37.74 
 
 
339 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  34.53 
 
 
374 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  37.74 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  35.96 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  35.02 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  38.1 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  37.74 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  37.74 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  37.74 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  37.74 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  37.74 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  38.26 
 
 
316 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  37.94 
 
 
356 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  36.89 
 
 
411 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  38.26 
 
 
316 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  37.01 
 
 
341 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  34.59 
 
 
350 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  36.04 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  34.57 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  36.31 
 
 
361 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  37.46 
 
 
362 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  34.14 
 
 
327 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>