More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1301 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  100 
 
 		 316 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  45.36 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  41.53 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  43.04 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  39.33 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  41.47 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  43.71 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  42.24 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  39.8 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  44.68 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  39.33 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  42.62 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  40.4 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  40.4 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  38.89 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  41.69 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  41.61 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  38.59 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  38.85 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.1 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.67 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  39.43 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  38.71 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  38.44 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.25 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.5 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.58 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  36.33 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.49 
 
 		 368 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  38.33 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  37.13 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  39.23 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.52 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  37.88 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  40.13 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  33.99 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.14 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  38.28 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  36.48 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  35.22 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  37.13 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.65 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  38.61 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  36.05 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.21 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  38.61 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  38.19 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  38.28 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  37.01 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  34.98 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  34.95 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0169  biotin synthase  37.72 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  34.6 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  34.59 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  34.59 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.83 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.37 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.91 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  34.97 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  35.44 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0160  biotin synthase  37 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.95 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  37.21 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1677  biotin synthase  36.79 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2057  biotin synthase  36.43 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  35.08 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  35.14 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0176  biotin synthase  37.55 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0644225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2293  biotin synthase  37.68 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  35.83 
 
 		 366 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  37.04 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1853  biotin synthase  36.07 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0574  biotin synthase  36.53 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  36.01 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  34.5 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  36.03 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  34.82 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  34.71 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  36.88 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  35.48 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  34.21 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  37.09 
 
 		 363 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  32.56 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  34.53 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  34.62 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2231  biotin synthase  37.32 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  33.23 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  33.87 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  33.55 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  35.4 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  34.33 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  32.89 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>