More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0169 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0169  biotin synthase  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2231  biotin synthase  57.04 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2293  biotin synthase  52.17 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0176  biotin synthase  55.51 
 
 		 275 aa  306  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0644225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1853  biotin synthase  52.36 
 
 		 278 aa  301  6.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1677  biotin synthase  52 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2057  biotin synthase  51.64 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0160  biotin synthase  51.09 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0574  biotin synthase  49.64 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  38.99 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37.72 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  41.22 
 
 		 359 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.03 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.82 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  37.14 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  37.73 
 
 		 320 aa  178  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  35.27 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  37.27 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  38.24 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.22 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.22 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  36.8 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  38.35 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  39.64 
 
 		 327 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  39.27 
 
 		 319 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  37.99 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  36.92 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  37.01 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  40.22 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  36.53 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  34.19 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  34.44 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  35.74 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  33.57 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  34.29 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.06 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.07 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  33.69 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  35.34 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  34.31 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  33.69 
 
 		 331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  39.25 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  36.96 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  36 
 
 		 361 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  35.4 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  35.64 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  35.02 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  37.5 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  34.19 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  37.37 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  37.37 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.17 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  35.56 
 
 		 324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  36.8 
 
 		 344 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.04 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  35.27 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  34.19 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  35.82 
 
 		 374 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  33.96 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  36.1 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  35.44 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  33.86 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.68 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  35.38 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  36.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.17 
 
 		 321 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  30.88 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  34.53 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  32.13 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  32.13 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  32.13 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  35.31 
 
 		 326 aa  158  7e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  36.06 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  31.65 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  34.81 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  33.45 
 
 		 330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  33.21 
 
 		 338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  36.62 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  33.45 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  34.3 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  33.33 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  32.86 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  33.82 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  33.81 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  32.5 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  32.86 
 
 		 350 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  32.1 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  33.93 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  34.33 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  33.46 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  31.41 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  35.04 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  33.82 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  33.81 
 
 		 332 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>