More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0160 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0160  biotin synthase  100 
 
 		 278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1677  biotin synthase  80.58 
 
 		 278 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2057  biotin synthase  79.86 
 
 		 278 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1853  biotin synthase  79.86 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0176  biotin synthase  69.09 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0644225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0574  biotin synthase  67.75 
 
 		 279 aa  391  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2293  biotin synthase  65.58 
 
 		 279 aa  386  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2231  biotin synthase  58.12 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0169  biotin synthase  51.09 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.57 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  41.85 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  40.29 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  39.13 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.13 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.48 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  39.85 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  37.28 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  36.92 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  36.6 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  37.64 
 
 		 320 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  37.22 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.56 
 
 		 364 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  35.97 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  37.31 
 
 		 361 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  37.97 
 
 		 335 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  36.6 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  35.14 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  36.74 
 
 		 322 aa  178  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  36.6 
 
 		 331 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  35.61 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  41.45 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  36.47 
 
 		 349 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  36.19 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  35.69 
 
 		 335 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  34.42 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  38.41 
 
 		 359 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  36.5 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.57 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  35.34 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  35.34 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  35.34 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  37.27 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  36.23 
 
 		 364 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  36.63 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  37.27 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  37.3 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  34.78 
 
 		 361 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  34.7 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  33.09 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.93 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  34.42 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  32.59 
 
 		 358 aa  168  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.34 
 
 		 341 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  35.9 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  38.1 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  38.04 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  35.87 
 
 		 345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  33.81 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  38.32 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  35.06 
 
 		 326 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  33.21 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  37 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  34.55 
 
 		 332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.85 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  36.63 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  36.09 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  34.3 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  34.93 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  34.05 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  32.73 
 
 		 393 aa  161  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  33.46 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  35.4 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  35.4 
 
 		 336 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  35.51 
 
 		 368 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  36.1 
 
 		 331 aa  161  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  35.4 
 
 		 339 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  35.4 
 
 		 339 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  35.4 
 
 		 339 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  36 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  35.4 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  35.51 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  34.06 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  35.16 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  34.43 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  35.58 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  34.3 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  35.58 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  35.51 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  33.09 
 
 		 334 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  33.33 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.04 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  34.8 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  35.58 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>