More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3698 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  100 
 
 
331 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  80.06 
 
 
332 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  75.76 
 
 
349 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  76.29 
 
 
358 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  73.41 
 
 
335 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  76.29 
 
 
341 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  74.62 
 
 
331 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  75.53 
 
 
331 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  75.23 
 
 
331 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  74.77 
 
 
345 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  73.03 
 
 
347 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  73.41 
 
 
339 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  75.53 
 
 
331 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  76.9 
 
 
361 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  72.51 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  75.23 
 
 
331 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  75.23 
 
 
331 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  75.23 
 
 
331 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  70 
 
 
334 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  71.34 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  70.3 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  68.75 
 
 
335 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  40.2 
 
 
326 aa  239  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  43.92 
 
 
359 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  37.82 
 
 
332 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  39.68 
 
 
376 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  43.58 
 
 
370 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  42.28 
 
 
388 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  38.59 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  36.51 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  41.16 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  41.16 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  42.72 
 
 
361 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.26 
 
 
329 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  42.95 
 
 
361 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  41.03 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  42.95 
 
 
361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  35.95 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  41.75 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  212  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.51 
 
 
332 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.12 
 
 
329 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  36.08 
 
 
332 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  40.07 
 
 
329 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  38.29 
 
 
324 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  38.78 
 
 
333 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  36.92 
 
 
331 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  35.76 
 
 
332 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.15 
 
 
332 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.68 
 
 
364 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  37.3 
 
 
333 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.58 
 
 
328 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  36.34 
 
 
328 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.91 
 
 
324 aa  202  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  36.02 
 
 
328 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  36.16 
 
 
331 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  37.86 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  36.84 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  37.8 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  37.7 
 
 
345 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  37.7 
 
 
345 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  36.82 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  36.22 
 
 
322 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  36.22 
 
 
339 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  36.22 
 
 
339 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  36.11 
 
 
321 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  36.22 
 
 
339 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  36.22 
 
 
336 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.54 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  39.58 
 
 
327 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  36.77 
 
 
374 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.22 
 
 
321 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  37.38 
 
 
345 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  35.74 
 
 
315 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  35.74 
 
 
315 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  36.22 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  38.51 
 
 
412 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  38.06 
 
 
344 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  36.43 
 
 
354 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  37.84 
 
 
350 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  36.49 
 
 
360 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.67 
 
 
339 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  36.15 
 
 
359 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  38.44 
 
 
326 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  35.74 
 
 
352 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  38.12 
 
 
361 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  36.82 
 
 
350 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  36.82 
 
 
350 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  36.82 
 
 
350 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  35.9 
 
 
339 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  39.12 
 
 
345 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  34.15 
 
 
337 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  35.4 
 
 
350 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  35.1 
 
 
350 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>