More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2347 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  100 
 
 		 321 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  77.67 
 
 		 335 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  77.67 
 
 		 335 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  57.68 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  58.93 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  55.7 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  56.43 
 
 		 332 aa  361  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  53.94 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  53.94 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  53.94 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  53.94 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  53.94 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  54.26 
 
 		 332 aa  358  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  53.63 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  53.63 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  53.63 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  53.63 
 
 		 332 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  49.53 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  48.11 
 
 		 344 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  45.25 
 
 		 412 aa  311  9e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  46.23 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  45.79 
 
 		 363 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  45.28 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  44.79 
 
 		 374 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  42.63 
 
 		 354 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  42.9 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  44.48 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  38.49 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  39.37 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  40 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  39.43 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  39.06 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.17 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  39.56 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  41.67 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.75 
 
 		 329 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.25 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.94 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.44 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  38.63 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.56 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.05 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.49 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.51 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.27 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  39.93 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.5 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  38.01 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.42 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  38.39 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.05 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  36.59 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  35.64 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  36.66 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  36.02 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  34.18 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  37.42 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.85 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  34.62 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  37.42 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.31 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  34.19 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  35.92 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  34.07 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  36.95 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  35.29 
 
 		 361 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.71 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  37.25 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.3 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  39.72 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  36.22 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  37.93 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  38.76 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  34.31 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  36.62 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  34.5 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  33.95 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  34.24 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  33.75 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  34.24 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  34.91 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  36.27 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  36.05 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  34.84 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2150  biotin synthase  35.43 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  34.84 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  34.84 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.74 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  36.08 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  35.03 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  35.51 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  36.49 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.82 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  34.29 
 
 		 360 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  36.49 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.62 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  32.82 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  36.31 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  33.12 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  36.49 
 
 		 336 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>