More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0682 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  100 
 
 		 334 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  54.6 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  49.53 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  46.54 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  46.23 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  47.6 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  48.41 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  47.47 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  47.92 
 
 		 327 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  41.14 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  45.51 
 
 		 333 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  41.07 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  43.61 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  44.63 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  45.43 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  43.4 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  47.74 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  41.28 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  47.39 
 
 		 361 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  41.78 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  41.78 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  41.12 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  41.12 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  43.65 
 
 		 364 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  40.79 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  40.98 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  40.49 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  44.17 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  42.77 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  41.69 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  40.45 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  42.16 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  38.24 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  37.11 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  40.82 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  39.49 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  39.49 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  39.56 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  39.59 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  40.43 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  42.62 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  39.24 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  42.7 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  41.23 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  37.54 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  42.72 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  39.51 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  38.11 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  36.73 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  38.86 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  36.44 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  40.14 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  37.37 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  37.7 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  42.44 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  39.56 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  41.16 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  38.74 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  35.49 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  36.84 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.89 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  37.68 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  36 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  34.35 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.99 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  37.32 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.33 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  35.26 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  37.19 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  38.11 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  38.33 
 
 		 345 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  39.1 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  37.78 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  36.83 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.25 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  31.4 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  32.43 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  35.53 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0160  biotin synthase  35.97 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  36.36 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  37.41 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  36.54 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.16 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  37.34 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.68 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1853  biotin synthase  36.73 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  34.75 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  33.1 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  33.1 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  33.95 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  35.2 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  30.63 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1677  biotin synthase  36 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2057  biotin synthase  35.64 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>