More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2190 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  100 
 
 
337 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  69.63 
 
 
339 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  65.58 
 
 
337 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  61.38 
 
 
336 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  61.21 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.61 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  59.58 
 
 
337 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  40.67 
 
 
370 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  35.06 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  37.82 
 
 
328 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  37.5 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.59 
 
 
328 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  38.54 
 
 
320 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  38.53 
 
 
322 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  39.27 
 
 
375 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  40.73 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  38.8 
 
 
370 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  35.96 
 
 
329 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  35.41 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  35.69 
 
 
321 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  35.78 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  37.59 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  38.26 
 
 
325 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  36.68 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  36.01 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.78 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  35.26 
 
 
326 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  36.52 
 
 
333 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  33.91 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  36.06 
 
 
330 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  38.35 
 
 
332 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  35.96 
 
 
364 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  37.97 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.65 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.65 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.65 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.65 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.65 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  34.9 
 
 
338 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  33.44 
 
 
332 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  33.65 
 
 
333 aa  185  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  37.22 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  35.76 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  37.22 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  35.44 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  37.22 
 
 
332 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  36.31 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  39.08 
 
 
327 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  37.22 
 
 
331 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  32.06 
 
 
337 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  33.88 
 
 
321 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.12 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  34.49 
 
 
376 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  31.89 
 
 
326 aa  178  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  35.16 
 
 
334 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  32.55 
 
 
321 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  37.73 
 
 
359 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  34.16 
 
 
354 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.47 
 
 
333 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  33.77 
 
 
330 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  35.38 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.84 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  35.03 
 
 
316 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  34.22 
 
 
320 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  35.03 
 
 
316 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  35.96 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  35.96 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.14 
 
 
321 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  36.88 
 
 
316 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  33.68 
 
 
326 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  34.35 
 
 
331 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  32.2 
 
 
328 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  33.94 
 
 
388 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  31.95 
 
 
344 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  34.74 
 
 
320 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  33.12 
 
 
341 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  31.7 
 
 
337 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  32.1 
 
 
335 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  35.93 
 
 
338 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  32.89 
 
 
320 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  35.04 
 
 
327 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  35.96 
 
 
356 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  32.65 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  32.86 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  34.55 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  34.48 
 
 
358 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  32.65 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  33.77 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  35.25 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  35.25 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  35.25 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  30.98 
 
 
314 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  32.16 
 
 
331 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  35.04 
 
 
327 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  32.09 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  35.43 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  35.43 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  34.92 
 
 
339 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  32.82 
 
 
368 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  34.46 
 
 
374 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>