More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3415 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  100 
 
 		 374 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  59.85 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  58.06 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  60.24 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  54.97 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  56.95 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  52.62 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  49.85 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  50.61 
 
 		 333 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  50.47 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  50.16 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  48.33 
 
 		 331 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  49.84 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  47 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  47 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  50.62 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  44.79 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  42.86 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  42.09 
 
 		 321 aa  258  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  40.57 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  37.7 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  41.07 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  37.7 
 
 		 331 aa  232  9e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.72 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  37.43 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.72 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  41.16 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.36 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  36.39 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.76 
 
 		 370 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  39.26 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  40.31 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  38.01 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  33.23 
 
 		 338 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  40.99 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  36.59 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  39.08 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  32.92 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  35.2 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  39.16 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  39.16 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.81 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  39.19 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  38.78 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  32.61 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  36.86 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  37.11 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  37.33 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  37.28 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.44 
 
 		 321 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  36.52 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  38.73 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  37.19 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  32.99 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  37.69 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  33.74 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  37.74 
 
 		 349 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  31.56 
 
 		 329 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  38.6 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  38.05 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  35.96 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  33.43 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  37.5 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  36.89 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.14 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  38.83 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  39.29 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  36.98 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  38.25 
 
 		 361 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  35.31 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  36.98 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  37.89 
 
 		 361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  33.65 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  35.59 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  37.21 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.97 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  35.95 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  35.19 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  37.54 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  37.41 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  38.14 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  37.19 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  34.67 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  34.67 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  35.02 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  34.58 
 
 		 346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  34.83 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  37.5 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  37.38 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0319  biotin synthase  39.7 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225916  normal  0.0136703 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  33.55 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  33.55 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  35.47 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>